W realizacji zadań Wydział współpracuje ze wszystkimi wydziałami Urzędu, z gminami gdańskiego obszaru metropolitarnego, oraz starostwami z terenu województwa pomorskiego, a w szczególności z:
- Wydziałem Budżetu Miasta i Podatków w zakresie planowania i wykonywania budżetu oraz wieloletniej prognozy finansowej;
- Wydziałem Finansowym w zakresie realizacji dochodów i wydatków Urzędu oraz ewidencji księgowej mienia.