W realizacji zadań Biuro współpracuje ze wszystkimi wydziałami Urzędu, jednostkami organizacyjnymi Miasta oraz z gminami gdańskiego obszaru metropolitarnego, a w szczególności:
- w zakresie opracowywania koncepcji i wdrażania rozwiązań informatycznych usprawniających realizację zadań merytorycznych;
- w zakresie wyznaczania dla rozwiązań informatycznych: standardów, założeń architektonicznych;
- w zakresie opracowywania i wdrażania spójnych polityk bezpieczeństwa informacji;
- z jednostkami organizacyjnymi Miasta w zakresie uzyskiwania, utrzymywania i integracji zasobów miejskich infrastruktury informatycznej;
- z organizacjami aktywnymi w obszarze rozwoju społeczeństwa informacyjnego, w szczególności w celu aktywizacji postaw obywatelskich mieszkańców Gdańska;
- z Gdańskim Centrum Informatycznym w zakresie świadczonych usług informatycznych;
- z Wydziałem Kadr i Organizacji, Wydziałem Spraw Obywatelskich i Biurem Rady Miasta Gdańska w zakresie obsługi informatycznej wyborów;
- z Wydziałem Infrastruktury w zakresie ewidencji sprzętu komputerowego, informatycznego oprzyrządowania strukturalnego i przyłączy światłowodowych.
Biuro wykonuje zadania związane z nadzorem nad działalnością Gdańskiego Centrum Informatycznego.