Andrzej Bądkowski urodził się w 1946 r. w Toruniu. Jego ojciec Tadeusz był zastępcą starosty morskiego w Wejherowie i sędzią. Matka Anna pochodziła z rodziny ziemiańskiej. Był bratankiem Lecha Bądkowskiego, cichociemnego w czasach wojny, a w latach 70. animatora działań podziemnych oraz sygnatariusza porozumień sierpniowych w roku 1980.
Był absolwentem Liceum Ogólnokształcącego w Słupsku i Wydziału Chemicznego Politechniki Gdańskiej. Studia ukończył w 1969 r., a w latach 1994-1995 r. był stypendystą Uniwersytetu Erazma w Rotterdamie. Po powrocie do Polski założył Towarzystwo Gdańsk-Niderlandy.
Po studiach pracował w Wyższej Szkole Morskiej w Gdyni, gdzie zajmował się tematyką materiałów niebezpiecznych na statkach - najpierw w zespole Fizyki i Chemii, a następnie w Centrum Doskonalenia Kadr Oficerskich Floty Handlowej.
W 1973 roku rozpoczął pracę w Instytucie Morskim w Gdańsku, później zatrudniony był w Instytucie Kształtowania Środowiska w Gdańsku. Pełnił funkcję głównego specjalisty w Państwowej Inspekcji Ochrony Środowiska w Gdańsku do 1985 r. W latach 1985–1989 związany był ze Spółdzielnią Pracy Sozotechnik. Od 1989 r. był prywatnym przedsiębiorcą.
Był autorem ponad 200 artykułów, w tym wielu publikacji specjalistycznych i opracowań dotyczących substancji niebezpiecznych, m.in. „Zbioru kart charakterystyk” dla ponad kilku tysięcy różnego rodzaju substancji chemicznych. Z jego zbiorów danych od wielu lat systematycznie korzystają ośrodki informacji chemicznych w kraju.
Andrzej Bądkowski zmarł 27 lipca.
Andrzej Bądkowski spoczął na Cmentarzu Łostowickim
